Allí se mantuvo hasta el campeonato de la Segunda División Peruana 1965 cuando quedó en el último lugar, el décimo puesto, descendiendo a la Primera Amateur de la Liga del Callao. Fue campeón de esta liga en 1966 pues realizó un gran campeonato en el que venció a casi todos sus competidores tomando rumbo para retornar al fútbol profesional, pero en el Cuadrangular Interligas fue tercero detrás del Independiente Sacachispas del Distrito de Breña (que logró el ascenso a Segunda División) y Deportivo Bancoper de San Isidro.
