Comenzó ganando ante Albion (2:1), pero luego de no poder volver a vencer en los siguientes cinco partidos, fue cesado el director técnico Rolando Carlen. Los albicelestes comenzarían el campeonato 2006-07 con una sorpresiva derrota: 0:3 en su estadio ante Platense, pero rápidamente se repusieron y lograron salir campeones del Torneo Apertura, lo que les aseguraba disputar -al final del campeonato- una promoción por el ascenso contra el campeón del Clausura.
