El organismo oficial que regula este deporte a nivel nacional es la Federación de Fútbol de la República Kirguisa, que fue fundada en 1992, después de la disolución de la Unión Soviética. La federación gestiona la selección de fútbol de Kirguistán y la Výsshaya Liga, la primera división. Véanse también: Kirguistán en los Juegos Olímpicos, Selección de fútbol de Kirguistán y Liga de fútbol de Kirguistán.